报表分析的四大基本财务比率：变现能力比率、资产管理比率、负债比率和盈利能力比率基本都源于对外的三个主要财务报表，甚至于杜邦财务分析体系、沃尔评分法和综合评分法也不外乎是上述几个比率的有机结合。这样财务报表数据的可靠性和实用性就尤其重要了。财务报表质量的高低直接决定着资本市场的有效程度和社会自然资源配置的效率。但是在信息化时代的今天，管理者获取信息的方式已经发生了根本性的改变，财务报表的局限性日益表现出来。再者由于人为因素，报表数据的失真也不容忽视，如美国的“安然事件”、“世通造假”和我国的“银广夏”、渤海集团提供虚假财务数据等诸多例证都说明了财务报表的局限性。
一、人力资源价值与经营管理水平的局限
“以人为本”成为各行各业的经营理念，人力资源成为第一资源，那么随之派生的经营方式和经营理念也成为决定一个企业兴衰的重要因素。与物质资本投入不同，人力资源转为生产不是直截了当的，但对企业的生产、经营管理的作用和影响是巨大而深远的，特别是在高科技企业与信息产业里，拥有的人力资源和无形资产对企业整体价值的贡献远比有形资产大。而先进的经营方式、管理水平和独特的企业文化也无疑成为一种无形资产，它往往形成一种凝聚力，使企业整体升值，但现行的财务报表无法客观反映这种贡献。
二、财务报表的真实客观性会受人为因素影响
客观真实性是会计核算的一般原则，是指会计核算必须以实际发生的经济业务及证明经济业务发生的合法凭证为基础，而不受主观意志的支配。这项原则要求会计在核算的各个阶段，必须不偏不倚，使用真实的原始资料，客观、真实地提供会计信息，不得人为进行歪曲。在这项原则指导下编制的会计报表应当真实、客观地反映企业的财务状况和经营成果。实际上，财务造假的现象屡见不鲜。
三、财务报表数据提供的滞后性
财务报表对外披露的财务信息要有用、及时。这项原则要求当期的会计事项必须在当期内处理，不能延至下一会计期间。因为会计信息具有很强的时间性，如果错过了使用时间，就失去了对决策的影响力，就会变成无用的信息。及时性是会计信息重要的质量特征。但就企业年度财务报表而言，所披露的会计信息间隔过长，缺乏及时性。企业年度财务报告在年度终了后4个月内对外提供，报表使用人了解的是4个月以前的财务状况，至少现金流量表已经没有太大的参考价值了。
四、财务报表数据本身的局限性
(一)会计报表中的有些数据是通过估计得来的，受会计人员主观因素的影响较大
企业为了定期及时提供有用的会计信息，将企业延续不断的营业活动人为地划分为各个阶段，如年度、季度、月度。并在权责发生制的基础上，对企业的财务状况和经营成果进行定期确认和计量。在确认、计量过程中，当记入的交易或事项涉及未来事项不确定性时，例如，关于未来事项是否发生的不确定性以及关于未来事项的影响或时间的不确定性，必须予以估计入账。
(二)会计政策的选择影响可比性
会计政策是指企业在会计核算时所遵循的具体原则以及企业所采纳的具体会计处理方法。具体原则是指企业按照《企业会计准则》和国家统一的会计制度规定的原则所指定的适合本单位的会计制度中所采用的会计原则;具体会计处理方法是指企业在会计核算中从诸多可选择的会计处理方法中所选择的，适合本企业的会计处理方法。这从客观上导致由于选择会计政策的不同影响了会计报告的可比性。
(三)稳健原则要求预计损失而不预计收益，有可能夸大费用，少计收益和资产
稳健原则又称谨慎性原则，或称保守主义。它是针对经济活动中的不确定性因素，要求人们在会计处理上保持谨慎小心的态度，要充分估计到可能发生的风险和损失。谨慎原则要求体现于会计核算的全过程，包括会计确认、计量、报告等会计核算的各个方面。从会计确认来说，要求确认标准和方法建立在稳妥合理的基础上，从会计计量来说，要求不得高估资产和利润的数额，从会计报告来说，要求会计报告向会计信息的使用者提供尽可能全面的会计信息，特别是应报告有关可能发生的风险损失。但是往往有些企业出于特殊目的，借此设置秘密准备，漫无边际任意使用或歪曲使用谨慎原则，违反会计核算客观性，使财务报告失真。此外，谨慎性原则的使用缺乏一个刚性的标准。
(四)不能充分反映货币的时间价值
我国的会计准则，强调历史成本原则、谨慎原则。现行以历史成本为基础的财务报表，不能客观地反映会计期末资本的真实价值或现行成本、变现价值，没有考虑不同程度的通货膨胀和资金的时间价值。通货膨胀会使资产负债表、损益表中的各项数据严重地歪曲。会计核算以货币计量为基本前提，而币值稳定是货币计量假设的内容之一。虽然出于谨慎性原则，会计准则中允许计提八项资产减值准备，但整体会计核算还是以历史成本计量，对于物价持续上涨或持续下跌，且涨跌剧烈的情况下，由于一些主客观因素，也不能完全在财务报告中反映这一事实。特别是资金的时间价值，这一在财务管理中的重要概念并没有与会计核算有机结合。
五、信息披露不够客观和完整
信息披露主要是财务报告的文字部分，包括会计报表附注和财务情况说明书。会计报表附注的披露应当遵循客观性原则如实反映。但往往一些企业出于自身利益对一些应当披露而不披露的事项予以隐瞒。如未作记录的或有负债、可能的质量事故赔偿、未决诉讼及担保等，以上事项由于不满足确认和计量条件而没有在财务报表中反映。这样无疑使报表使用人高估企业价值。
六、分析方法及指标自身的局限
财务指标缺乏统一的一般性的标准，工业发达国家如美国、日本的一些政府和金融机构，定期分布各行业的财务方面的统计指标，甚至同行业企业的工会与个别公司的信用部门，也搜集产业平均财务比率的资料。然而目前某些报刊提供的部分行业财务数据往往行业划分较粗，抽样误差较大，缺乏一定的代表性，使会计报表使用者无所适从。现行财务分析指标常常是重“量”而忽视“质”，会计报表较难揭示详实的资料，因而使会计报表使用者较难取得诸如存货结构、资产结构、批量大小、季节性生产变化等信息。
